Dans un vingt et unième siècle imaginaire, des scientifiques japonais perfectionnent à ce point la biotechnologie et la robotique qu'ils trouvent un moyen d'allonger la vie. Méfiant, l'ONU se met à surveiller de près leurs activités. Jusqu'à leur demander de stopper leurs recherches. Le gouvernement japonais refuse et, en 2067, quitte l'ONU pour s'isoler complètement du reste du monde.
10 ans plus tard, suite à un incident mettant en cause un androïde, l'unité américaine SWORD, dirigée par son commandant Vexille, s'infiltre au Japon pour découvrir ce qui s'y passe...
